Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp4P59240 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms