Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gsc2P56916 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gsc2P56916 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gsc2P56916 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gsc2P56916 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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