Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CckbrP56481 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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