Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PctpP53808 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PctpP53808 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms