Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
FmodP50608 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
FmodP50608 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms