Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms