Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PtpreP49446 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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