Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rab11bP46638 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab11bP46638 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rab11bP46638 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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