Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms