Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.84
VhlP40338 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VhlP40338 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VhlP40338 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms