Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tfap2aP34056 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms