Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Saa4P31532 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms