Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms