Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms