Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxraP28700 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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RxraP28700 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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