Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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