Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb1P28230 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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