Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms