Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NelfeP19426 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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