Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18530 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18530 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18530 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18530 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms