Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P18528 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P18528 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms