Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P18525 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18525 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms