Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18524 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms