Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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