Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PcnaP17918 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PcnaP17918 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms