Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms