Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms