Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DmdP11531 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
DmdP11531 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
DmdP11531 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms