Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd4P10628 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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