Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Myod1P10085 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Myod1P10085 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms