Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SparcP07214 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SparcP07214 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms