Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ccl20O89093 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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