Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ptpn20O55082 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ptpn20O55082 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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