Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Psmb10O35955 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Psmb10O35955 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Psmb10O35955 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Psmb10O35955 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Psmb10O35955 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Psmb10O35955 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms