Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Sp100O35892 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms