Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms