Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6401L7N2C0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6401L7N2C0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6401L7N2C0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6401L7N2C0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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