Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm3727J3QM54 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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