Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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