Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rdh19G5E8H9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh19G5E8H9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms