Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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