Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc8E9PWG2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms