Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms