Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Prrt4B2RU40 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Prrt4B2RU40 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt4B2RU40 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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