Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CK137956B1AYM9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms