Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trabd2bB1ATG9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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