Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprsB0V2N1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprsB0V2N1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms