Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Tmem238A9JSM3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms