Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Odf2A3KGV1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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