Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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